Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp140Q6NSQ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms