Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retreg2Q6NS82 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retreg2Q6NS82 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retreg2Q6NS82 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms