Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11bQ6DFW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp11bQ6DFW5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms