Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4bp1Q6A037 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4bp1Q6A037 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
N4bp1Q6A037 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4bp1Q6A037 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
N4bp1Q6A037 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms