Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CltcQ68FD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CltcQ68FD5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CltcQ68FD5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CltcQ68FD5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CltcQ68FD5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CltcQ68FD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms