Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf1Q64213 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf1Q64213 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf1Q64213 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf1Q64213 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf1Q64213 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf1Q64213 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf1Q64213 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf1Q64213 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf1Q64213 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms