Protein–RNA interactions for Protein: Q64151

Sema4c, Semaphorin-4C, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4cQ64151 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4cQ64151 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4cQ64151 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4cQ64151 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema4cQ64151 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4cQ64151 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4cQ64151 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4cQ64151 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4cQ64151 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms