Protein–RNA interactions for Protein: Q64096

Mcf2l, Guanine nucleotide exchange factor DBS, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2lQ64096 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcf2lQ64096 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcf2lQ64096 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mcf2lQ64096 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mcf2lQ64096 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcf2lQ64096 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms