Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab34Q64008 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab34Q64008 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab34Q64008 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab34Q64008 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms