Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Kdm5dQ62240 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Kdm5dQ62240 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Kdm5dQ62240 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Kdm5dQ62240 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC43.32■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Kdm5dQ62240 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Kdm5dQ62240 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Kdm5dQ62240 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Kdm5dQ62240 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms