Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamb3Q61087 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lamb3Q61087 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms