Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinQ61043 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinQ61043 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinQ61043 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinQ61043 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NinQ61043 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NinQ61043 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinQ61043 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinQ61043 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinQ61043 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinQ61043 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinQ61043 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinQ61043 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinQ61043 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinQ61043 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinQ61043 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinQ61043 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinQ61043 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinQ61043 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinQ61043 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinQ61043 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinQ61043 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinQ61043 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinQ61043 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinQ61043 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NinQ61043 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NinQ61043 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NinQ61043 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NinQ61043 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinQ61043 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinQ61043 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinQ61043 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinQ61043 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinQ61043 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinQ61043 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinQ61043 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinQ61043 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinQ61043 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinQ61043 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinQ61043 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinQ61043 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinQ61043 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinQ61043 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinQ61043 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NinQ61043 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NinQ61043 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NinQ61043 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NinQ61043 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinQ61043 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinQ61043 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinQ61043 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NinQ61043 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NinQ61043 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NinQ61043 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinQ61043 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinQ61043 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinQ61043 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NinQ61043 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NinQ61043 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NinQ61043 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NinQ61043 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NinQ61043 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinQ61043 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinQ61043 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinQ61043 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinQ61043 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinQ61043 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinQ61043 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NinQ61043 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinQ61043 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinQ61043 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinQ61043 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinQ61043 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinQ61043 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinQ61043 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinQ61043 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinQ61043 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinQ61043 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinQ61043 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinQ61043 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinQ61043 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinQ61043 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinQ61043 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinQ61043 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinQ61043 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinQ61043 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinQ61043 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinQ61043 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinQ61043 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinQ61043 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinQ61043 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinQ61043 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinQ61043 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinQ61043 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinQ61043 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinQ61043 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinQ61043 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinQ61043 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NinQ61043 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NinQ61043 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms