Protein–RNA interactions for Protein: Q60953

Pml, Protein PML, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmlQ60953 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmlQ60953 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmlQ60953 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmlQ60953 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmlQ60953 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmlQ60953 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmlQ60953 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmlQ60953 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PmlQ60953 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PmlQ60953 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PmlQ60953 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmlQ60953 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmlQ60953 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmlQ60953 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmlQ60953 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmlQ60953 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmlQ60953 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PmlQ60953 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PmlQ60953 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmlQ60953 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmlQ60953 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmlQ60953 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PmlQ60953 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmlQ60953 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmlQ60953 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmlQ60953 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmlQ60953 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PmlQ60953 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmlQ60953 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmlQ60953 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PmlQ60953 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmlQ60953 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmlQ60953 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmlQ60953 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmlQ60953 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmlQ60953 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmlQ60953 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmlQ60953 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmlQ60953 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmlQ60953 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PmlQ60953 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PmlQ60953 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmlQ60953 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmlQ60953 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmlQ60953 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmlQ60953 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmlQ60953 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmlQ60953 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmlQ60953 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmlQ60953 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms