Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctf1Q60753 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctf1Q60753 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctf1Q60753 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms