Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd4Q60688 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd4Q60688 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxd4Q60688 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms