Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Myh1Q5SX40 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myh1Q5SX40 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Myh1Q5SX40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Myh1Q5SX40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myh1Q5SX40 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms