Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SynrgQ5SV85 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SynrgQ5SV85 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynrgQ5SV85 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms