Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc88aQ5SNZ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc88aQ5SNZ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms