Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Trim41Q5NCC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Trim41Q5NCC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Trim41Q5NCC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Trim41Q5NCC3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Trim41Q5NCC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Trim41Q5NCC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Trim41Q5NCC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 545.4 ms