Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm12185Q5NCB2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gm12185Q5NCB2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm12185Q5NCB2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm12185Q5NCB2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm12185Q5NCB2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm12185Q5NCB2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm12185Q5NCB2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm12185Q5NCB2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm12185Q5NCB2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm12185Q5NCB2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms