Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eri2Q5BKS4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eri2Q5BKS4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms