Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Znf608Q56A10 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Znf608Q56A10 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Znf608Q56A10 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Znf608Q56A10 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Znf608Q56A10 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Znf608Q56A10 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms