Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shank3Q4ACU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Shank3Q4ACU6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Shank3Q4ACU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Shank3Q4ACU6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms