Protein–RNA interactions for Protein: Q45HK4

Sh2d1b2, SH2 domain-containing protein 1B2, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1b2Q45HK4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh2d1b2Q45HK4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2d1b2Q45HK4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh2d1b2Q45HK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh2d1b2Q45HK4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh2d1b2Q45HK4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d1b2Q45HK4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d1b2Q45HK4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d1b2Q45HK4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d1b2Q45HK4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms