Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pacs2Q3V3Q7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pacs2Q3V3Q7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms