Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3V0E1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3V0E1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3V0E1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3V0E1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3V0E1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3V0E1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3V0E1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3V0E1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3V0E1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3V0E1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3V0E1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3V0E1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3V0E1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3V0E1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 547.4 ms