Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330034G19RikQ3UWX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms