Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D130052B06RikQ3UW13 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D130052B06RikQ3UW13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.06■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130052B06RikQ3UW13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms