Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtpbp2Q3UJK4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp2Q3UJK4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp2Q3UJK4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp2Q3UJK4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms