Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf224Q3UIW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf224Q3UIW8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf224Q3UIW8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf224Q3UIW8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf224Q3UIW8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf224Q3UIW8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf224Q3UIW8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf224Q3UIW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf224Q3UIW8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf224Q3UIW8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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