Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtpbp6Q3U6U5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtpbp6Q3U6U5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gtpbp6Q3U6U5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms