Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hhla1Q3TYV2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hhla1Q3TYV2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hhla1Q3TYV2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms