Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmd1Q3TXS7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psmd1Q3TXS7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Psmd1Q3TXS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psmd1Q3TXS7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms