Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D17Wsu92eQ3TT38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
D17Wsu92eQ3TT38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D17Wsu92eQ3TT38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms