Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ctdnep1Q3TP92 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctdnep1Q3TP92 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctdnep1Q3TP92 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms