Protein–RNA interactions for Protein: Q2EY15

Prtg, Protogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrtgQ2EY15 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrtgQ2EY15 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrtgQ2EY15 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrtgQ2EY15 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrtgQ2EY15 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms