Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 HXT15YDL245C 1704 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 HXT16YJR158W 1704 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 PPM2YOL141W 2088 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 MPH3YJR160C 1809 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 CCT3YJL014W 1605 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 CBR1YIL043C 855 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 COX16YJL003W 357 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 HOC1YJR075W 1191 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 GCN3YKR026C 918 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 YOR389WYOR389W 1875 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 MSC3YLR219W 2187 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 EHD3YDR036C 1503 nt5.79□□□□□ -1.48
USB1Q12208 YHR020WYHR020W 2067 nt5.78□□□□□ -1.48
USB1Q12208 YOR111WYOR111W 699 nt5.78□□□□□ -1.48
USB1Q12208 MKK1YOR231W 1527 nt5.78□□□□□ -1.48
USB1Q12208 RGD2YFL047W 2145 nt5.77□□□□□ -1.49
USB1Q12208 BIO3YNR058W 1443 nt5.77□□□□□ -1.49
USB1Q12208 PPH22YDL188C 1134 nt5.77□□□□□ -1.49
USB1Q12208 HED1YDR014W-A 489 nt5.77□□□□□ -1.49
USB1Q12208 LIA1YJR070C 978 nt5.77□□□□□ -1.49
USB1Q12208 SEC23YPR181C 2307 nt5.76□□□□□ -1.49
USB1Q12208 LDB7YBL006C 543 nt5.76□□□□□ -1.49
USB1Q12208 YNR014WYNR014W 639 nt5.76□□□□□ -1.49
USB1Q12208 EFM1YHL039W 1758 nt5.75□□□□□ -1.49
USB1Q12208 GPD1YDL022W 1176 nt5.75□□□□□ -1.49
USB1Q12208 RNH1YMR234W 1047 nt5.75□□□□□ -1.49
USB1Q12208 COX10YPL172C 1389 nt5.75□□□□□ -1.49
USB1Q12208 GSH1YJL101C 2037 nt5.75□□□□□ -1.49
USB1Q12208 CUE4YML101C 354 nt5.74□□□□□ -1.49
USB1Q12208 IRC11YOR013W 471 nt5.74□□□□□ -1.49
USB1Q12208 SEC62YPL094C 825 nt5.74□□□□□ -1.49
USB1Q12208 YBR284WYBR284W 2394 nt5.74□□□□□ -1.49
USB1Q12208 CYS4YGR155W 1524 nt5.74□□□□□ -1.49
USB1Q12208 HIS1YER055C 894 nt5.73□□□□□ -1.49
USB1Q12208 OPI11YPR044C 354 nt5.73□□□□□ -1.49
USB1Q12208 YHK8YHR048W 1545 nt5.73□□□□□ -1.49
USB1Q12208 FMP40YPL222W 2067 nt5.73□□□□□ -1.49
USB1Q12208 FCY22YER060W-A 1593 nt5.72□□□□□ -1.49
USB1Q12208 ATF1YOR377W 1578 nt5.72□□□□□ -1.49
USB1Q12208 YKR032WYKR032W 315 nt5.72□□□□□ -1.49
USB1Q12208 YFR006WYFR006W 1608 nt5.72□□□□□ -1.49
USB1Q12208 COQ1YBR003W 1422 nt5.72□□□□□ -1.49
USB1Q12208 SLA2YNL243W 2907 nt5.71□□□□□ -1.49
USB1Q12208 YDR415CYDR415C 1125 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 ASF1YJL115W 840 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 TPK1YJL164C 1194 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 MEU1YLR017W 1014 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 RFC4YOL094C 972 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 GPH1YPR160W 2709 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 RIX7YLL034C 2514 nt5.71□□□□□ -1.5
USB1Q12208 RQC1YDR333C 2172 nt5.7□□□□□ -1.5
USB1Q12208 PEX31YGR004W 1389 nt5.7□□□□□ -1.5
USB1Q12208 MRPL35YDR322W 1104 nt5.7□□□□□ -1.5
USB1Q12208 MIA40YKL195W 1212 nt5.7□□□□□ -1.5
USB1Q12208 KSH1YNL024C-A 219 nt5.7□□□□□ -1.5
USB1Q12208 RPL5YPL131W 894 nt5.7□□□□□ -1.5
USB1Q12208 VMA2YBR127C 1554 nt5.7□□□□□ -1.5
USB1Q12208 DOT1YDR440W 1749 nt5.69□□□□□ -1.5
USB1Q12208 FMO1YHR176W 1299 nt5.69□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YRB2YIL063C 984 nt5.69□□□□□ -1.5
USB1Q12208 OPI8YKR035C 642 nt5.69□□□□□ -1.5
USB1Q12208 ADH5YBR145W 1056 nt5.69□□□□□ -1.5
USB1Q12208 EDE1YBL047C 4146 nt5.69□□□□□ -1.5
USB1Q12208 EMP65YER140W 1671 nt5.69□□□□□ -1.5
USB1Q12208 NSE5YML023C 1671 nt5.69□□□□□ -1.5
USB1Q12208 JIP4YDR475C 2631 nt5.68□□□□□ -1.5
USB1Q12208 FZF1YGL254W 900 nt5.68□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.68□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YJR107WYJR107W 987 nt5.68□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YAR064WYAR064W 300 nt5.68□□□□□ -1.5
USB1Q12208 TAF9YMR236W 474 nt5.68□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YPT1YFL038C 621 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 RRN10YBL025W 438 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YNL092WYNL092W 1203 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 RUF23RUF23 254 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 ATP4YPL078C 735 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YBR113WYBR113W 483 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 STT3YGL022W 2157 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 CRH1YGR189C 1524 nt5.67□□□□□ -1.5
USB1Q12208 PRY3YJL078C 2646 nt5.66□□□□□ -1.5
USB1Q12208 HXT17YNR072W 1695 nt5.66□□□□□ -1.5
USB1Q12208 SKY1YMR216C 2229 nt5.66□□□□□ -1.5
USB1Q12208 TOS6YNL300W 309 nt5.66□□□□□ -1.5
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