Protein–RNA interactions for Protein: Q12140

BSC1, Bypass of stop codon protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BSC1Q12140 YNL165WYNL165W 1221 nt6.21□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 FCY22YER060W-A 1593 nt6.21□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 ICL2YPR006C 1728 nt6.21□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 YLR173WYLR173W 1827 nt6.2□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 MRPL35YDR322W 1104 nt6.2□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 YJR107WYJR107W 987 nt6.2□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.2□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 YKL102CYKL102C 306 nt6.2□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 LSC1YOR142W 990 nt6.2□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 PPM2YOL141W 2088 nt6.2□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 ECM27YJR106W 2178 nt6.2□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 COQ1YBR003W 1422 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 STT3YGL022W 2157 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 HEM2YGL040C 1029 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 SWD1YAR003W 1281 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 TOS6YNL300W 309 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 TMA46YOR091W 1038 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 EDC3YEL015W 1656 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 BDF2YDL070W 1917 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 CCR4YAL021C 2514 nt6.19□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 MIP1YOR330C 3765 nt6.18□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 GPD1YDL022W 1176 nt6.18□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 CTF8YHR191C 402 nt6.18□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 YKL077WYKL077W 1179 nt6.18□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 LCL3YGL085W 825 nt6.16□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 ATG36YJL185C 882 nt6.16□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 GCN3YKR026C 918 nt6.16□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 MRPL23YOR150W 492 nt6.16□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 YBR113WYBR113W 483 nt6.16□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 HEM1YDR232W 1647 nt6.16□□□□□ -1.42
BSC1Q12140 YDR415CYDR415C 1125 nt6.14□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YHM2YMR241W 945 nt6.14□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 RSP5YER125W 2430 nt6.14□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 DID2YKR035W-A 615 nt6.13□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 SUR7YML052W 909 nt6.13□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 CUE4YML101C 354 nt6.13□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 CCC2YDR270W 3015 nt6.12□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 EDE1YBL047C 4146 nt6.12□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YPT1YFL038C 621 nt6.12□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 ASF1YJL115W 840 nt6.12□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YJL211CYJL211C 444 nt6.12□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 ARP3YJR065C 1350 nt6.12□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 RNH1YMR234W 1047 nt6.12□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 SAL1YNL083W 1485 nt6.11□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 COX10YPL172C 1389 nt6.11□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 HIS1YER055C 894 nt6.11□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 DFR1YOR236W 636 nt6.11□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 SKY1YMR216C 2229 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YPL277CYPL277C 1464 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 FMO1YHR176W 1299 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YRB2YIL063C 984 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 TAF9YMR236W 474 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 RFC4YOL094C 972 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 ILV6YCL009C 930 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 RTG2YGL252C 1767 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YKR023WYKR023W 1593 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 ARG81YML099C 2643 nt6.1□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.09□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YJR146WYJR146W 354 nt6.09□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 FBA1YKL060C 1080 nt6.09□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 MIA40YKL195W 1212 nt6.09□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YAR064WYAR064W 300 nt6.09□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 SWP1YMR149W 861 nt6.09□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YOR111WYOR111W 699 nt6.09□□□□□ -1.43
BSC1Q12140 YHK8YHR048W 1545 nt6.09□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 SES1YDR023W 1389 nt6.08□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 YKR032WYKR032W 315 nt6.08□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 OGG1YML060W 1131 nt6.08□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 YNL120CYNL120C 486 nt6.08□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.08□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 EEB1YPL095C 1371 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 GCD11YER025W 1584 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 YPR204WYPR204W 3099 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 AIM33YML087C 939 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 KSH1YNL024C-A 219 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 COX5AYNL052W 462 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 MRPS18YNL306W 654 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 PHO3YBR092C 1404 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 CLN1YMR199W 1641 nt6.07□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 MAK32YCR019W 1092 nt6.06□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 NSG2YNL156C 900 nt6.06□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 UTR2YEL040W 1404 nt6.06□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 PMT3YOR321W 2262 nt6.05□□□□□ -1.44
BSC1Q12140 GPD2YOL059W 1323 nt6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.9 ms