Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bpifa6Q0VGU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bpifa6Q0VGU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bpifa6Q0VGU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bpifa6Q0VGU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa6Q0VGU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms