Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rundc1Q0VDN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rundc1Q0VDN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rundc1Q0VDN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rundc1Q0VDN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms