Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cib3Q0P523 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cib3Q0P523 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib3Q0P523 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms