Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnma1Q08460 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnma1Q08460 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnma1Q08460 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnma1Q08460 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms