Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 ERS1YCR075C 783 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 DMC1YER179W 1005 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 DUG1YFR044C 1446 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 IRC5YFR038W 2562 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 ESC8YOL017W 2145 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 PPM1YDR435C 987 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 YPR130CYPR130C 408 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 RIX7YLL034C 2514 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 LAT1YNL071W 1449 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 CIS3YJL158C 684 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 GET4YOR164C 939 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 YBR124WYBR124W 360 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 PDA1YER178W 1263 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 HSP150YJL159W 1242 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 YOX1YML027W 1158 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 CWC27YPL064C 906 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 snR30snR30 606 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 MET8YBR213W 825 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 HBN1YCL026C-B 582 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 NAF1YNL124W 1479 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 STE13YOR219C 2796 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 PLB2YMR006C 2121 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 THR1YHR025W 1074 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 MIX17YMR002W 471 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 IMA5YJL216C 1746 nt5.4□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 CIA1YDR267C 993 nt5.4□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 YNR014WYNR014W 639 nt5.4□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 YCR049CYCR049C 447 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 AIM46YHR199C 933 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YML6YML025C 861 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 TRP5YGL026C 2124 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 HAS1YMR290C 1518 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 ATF1YOR377W 1578 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 TEL2YGR099W 2067 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 DLD1YDL174C 1764 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 MRPL28YDR462W 444 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 OAC1YKL120W 975 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 HTZ1YOL012C 405 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 MRP51YPL118W 1035 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YCL049CYCL049C 939 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 CEM1YER061C 1329 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 MSG5YNL053W 1470 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 CTA1YDR256C 1548 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 ARG81YML099C 2643 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 HPT1YDR399W 666 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 COX16YJL003W 357 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YHC3YJL059W 1227 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YLR162WYLR162W 357 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YKR023WYKR023W 1593 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YPL247CYPL247C 1572 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 PEX13YLR191W 1161 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YNR005CYNR005C 405 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 MSS1YMR023C 1581 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 TPO3YPR156C 1869 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 SLA2YNL243W 2907 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YOL036WYOL036W 2286 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 GEP5YLR091W 882 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YOL099CYOL099C 492 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YOR300WYOR300W 309 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 NME1NME1 340 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 TKL1YPR074C 2043 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 YMR279CYMR279C 1623 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 AFG1YEL052W 1530 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 TIM22YDL217C 624 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 AIM33YML087C 939 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 NTG2YOL043C 1143 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 XBP1YIL101C 1944 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG39Q06159 IMA2YOL157C 1770 nt5.34□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 APE4YHR113W 1473 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 CRZ1YNL027W 2037 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 SML1YML058W 315 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 ZIM17YNL310C 525 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 COS10YNR075W 1125 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 PPH22YDL188C 1134 nt5.32□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 ATP4YPL078C 735 nt5.32□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 GPB2YAL056W 2643 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 YJL163CYJL163C 1668 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 SGV1YPR161C 1974 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 PAC2YER007W 1557 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 MCP1YOR228C 909 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 RPL5YPL131W 894 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 KEL1YHR158C 3495 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 FAT3YKL187C 2253 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 NSE5YML023C 1671 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 TUF1YOR187W 1314 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 SCT1YBL011W 2280 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 MTC5YDR128W 3447 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 URA1YKL216W 945 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 RHO4YKR055W 876 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 LGE1YPL055C 999 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 GEX1YCL073C 1848 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 IRS4YKR019C 1848 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 GEX2YKR106W 1848 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 YDR514CYDR514C 1452 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 PTC7YHR076W 1032 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 REC107YJR021C 945 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms