Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Fmn1Q05860 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Fmn1Q05860 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fmn1Q05860 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Fmn1Q05860 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms