Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme1P97371 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Psme1P97371 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Psme1P97371 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Psme1P97371 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psme1P97371 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Psme1P97371 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Psme1P97371 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Psme1P97371 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Psme1P97371 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Psme1P97371 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms