Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx1P83917 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx1P83917 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms