Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc8a1P70414 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc8a1P70414 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms