Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb13P70321 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb13P70321 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxb13P70321 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb13P70321 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms