Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprvP70289 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprvP70289 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprvP70289 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprvP70289 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprvP70289 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprvP70289 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtprvP70289 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprvP70289 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprvP70289 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms