Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd13P70217 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd13P70217 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd13P70217 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd13P70217 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms